Organism

USA300_FPR3757
SRD identifierCommon nameIntaRNAStartEndStrandLengthOther namesExperimental ValidationRNA-seq ValidationCategoryAuthors (references)
srn_2130rsaE 991418991876+459rsaE_RsaON_Sau20_Teg92_IGR6_sRNA183

Sequence

>USA300_FPR3757_srn_2130_rsaE
tactattgtattcgcttacattatgaacagattgtgacaatttaaattaagtactattaaaaggttgaaatggtagagatagcatgttatattatgaacatgaaattaatcacataacaaacatacccctttgtttgaagtgaaaaatttctcccatcccctttgtttagcgtcgtgtattcagacacgacgtttttttatgttcttttttaataagagggaagtgaagttgtataaaaatgtattaaatatgcactttttatacattaacgattcatatatgtctattatgtaccaaatttataatttgtataattttcgaactggttaaattcgaaaaatatcactaatatatttagatcgatgtgtaacattacgttctaataatttaatgttgcaaaattaagagtcagtaaaaagacctcgttacatttatggtgtacgaggtctttaatttat

Structure prediction (MFold)

External links to target and structure prediction

Target RNA2
RNA predator
MFold
CopraRNA
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