Organism

NCTC8325
SRD identifierCommon nameIntaRNAStartEndStrandLengthOther namesExperimental ValidationRNA-seq ValidationCategoryAuthors (references)
srn_1090Teg19as 416282418757-2476Teg19as_sRNA96ND

Sequence

>NCTC8325_srn_1090_Teg19as
tttcaatttagtacgatttatatttattatacagagggggtaaggcgtatcaatagagttatttttgtctatatagcgttaatcattacattagttagattctttacccctattcatccatcattttcaaatttgatttactggatatttgtattatattttattcctattatactatgcgttatcggtttcaaggccgaaaaacttattgcaacaatggtcattatacctaattttttaggaatactttatcgattatatgcctacgtcacacatatactctttatgtaaaaggatagtgggcatgtctcgcaacaaatatgcttgcgtcgacttgtcaccattcgcaaattttatgacatacgcctttcacgggctatattcagacccacgcattcatccacgtaataaacacatcatgtaatagaaaaacagcacacccaaatatatggcgttgcgctgtttaaccaagcatacttctatagctttaataagccagcagaagcatacctaaccttcttaaatatgcttttccaaattatcctcaagtttgaatacgataatacgttcacctgtaactgtacttaaatcactatggaagctcatcactttgatacctgtaattttaaaaatgatatcattcaaatcttgctcaccggattcaactaattcagaacgtgttcgtttaatatttaataatccttcattcgtactacatacacgatattcagctggcgttaagataccttgtaaactaataatcaccatatctcttaaaatgtctgatttaactgacaaggaacctctgccaaggaaatctttttcccattgcgtaatggctttactgatttcagcttcgatttcacctttcgttcttttcatatcactaactccaataatattaaaattgattacttcatctttgtatcgttatcacgacatcaactattacattaagtttatcatttttagtatattttaagaagctagaacattgtagatatgatgatatattagttacttagcatcgcaacatatcatcgttaaatccaacttttaaaacgcccttcctcattaacgctcattaaacgcagccaatgattagacaccttcctagcgaaatgctcattattcgcgagtagtcttgctacaacatagtcgggtgcctgaataacgacaagtaaacgaattggcgaatgatacatcgtccgatcagcagccataacagattgccatgataagccatacatcagatcactcgcattaccttgcatgacaccaacacctgacgtgacggtttgtgtcgctttattcccacttccgtaaaaatgcggcgcaactgtcgacgcataatattgtaaattaatccattgtgccacaagtgccggaccagaaatgatggtatttaataatgtgccatctttatctttacgccaatcataattgtgtaaaaatgtccgcccttctaaatcaatgccttttgttaattggcgtcgtccaattataaatgatgcatttttagccaatccccattctggacgtacctcactccaatcactcgcaaaccgctgcgcttcttccactggatgattcacacgaccaatcgttggcagtttgtccaaacgttcgcgattcgcgtgttcagaaatcatcggcatcgcgtcattcaatgattcatatgcatctaaagcaatagaagataatgtgtctggcacatatacccatgccaacgtatcagtagacgtatgatgttctgctaccgcaaaaacagttgtctctggaatatacacacctgattgttttaatccttgtctgacatttggacgattacatatcatcgctaataacttagcattaaaaccgcttgatgcgccaccacaagccccacattcaagtgatgcatgatgtggattattgtgagaatgactagcatgacctgctaacacaacgaacggcgcaaatgcttcggttaaatccatcaatttcaacgcttgtaacgcgaaatcaatttgctcttgctcagtaaatccaacaggtaagtctgatgttcggtcaaactcacgatcaatcgtcaactttgtttcaggctttttcaaccacttttgttttattttttgtaaagacgcgcgactttttctaggcataatcgaattgacaatggtacttaagcttaaaaatggcccacttaattcaggcaataacagactaggcatgacattatttttcatcaatttaaatgtgtaaaacatcgatgacattgtctgttgctgttgtcgataaacattcatatcgtagcggtctgcaaattctttaatgcgatatgccggcggtaccatgacaggtaatgaatcatgtttgaattgttcgtctacggcatctttttgaataggtaatccaaagaagcctgcaataccaatcgtttcaaagggccctgctgcttcgatatgtctacgaaatggttctgaacgaacatcta

Structure prediction (MFold)

External links to target and structure prediction

Target RNA2
RNA predator
MFold
CopraRNA
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