Organism

N315
SRD identifierCommon nameIntaRNAStartEndStrandLengthOther namesExperimental ValidationRNA-seq ValidationCategoryAuthors (references)
srn_2130rsaE 975284975742+459rsaE_RsaON_Sau20_Teg92_IGR6_sRNA183Transcript
Abu-Qatouseh_et_al._2010_and_Bohn_et_al._2010_and_Beaume_et_al._2010

Sequence

>N315_srn_2130_rsaE
tactattgtattcgcttacattatgaacagattgtgacaatttaaattaagtactattaaaaggttgaaatggtagagatagcatgttatattatgaacatgaaattaatcacataacaaacatacccctttgtttgaagtgaaaaatttctcccatcccctttgtttagcgtcgtgtattcagacacgacgtttttttatgttcttttttaataagagagaagtgaagttgtataaaaatgtattaaatatgcactttttatacattaacgattaatataagtctattatgtaccaaatttataatttgtataattttcgaactggttaaattcgaaaaatatcactaatatatttagatcgatgtgtaacattacgttctaataatttaatgttgcaaaattaagagtcagtaaaaagacctcgttacatttatggtgtacgaggtctttaatttat

Structure prediction (MFold)

External links to target and structure prediction

Target RNA2
RNA predator
MFold
CopraRNA
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