Organism

JKD6008
SRD identifierCommon nameIntaRNAStartEndStrandLengthOther namesExperimental ValidationRNA-seq ValidationCategoryAuthors (references)
srn_2130rsaE 10151471015605+459sRNA183_Teg92_rsaE_sau20_rsaONcis-acting_regulator
Howden_BP_et_al.2013

Sequence

>JKD6008_srn_2130_rsaE
tactattgtattcgcttacattatgaacagattgtgacaatttaaattaagtactattaaaaggttgaaatggtagagatagcatgttatattatgaacatgaaattaatcacataacaaacatacccctttgtttgaagtgaaaaatttctcccatcccctttgtttagcgtcgtgtattcagacacgacgtttttttatgttcttttttaataagagggaagtgaagttgtataaaaatgtattaaatatgcactttttatacattaacgattcatatatgtctattatgtaccaaatttataatttgtataattttcgaactggttaaattcgaaaaatatcactaatatatttagatcgatgtgtaacattacgttctaataatttaatgttgcaaaattaagagtcagtaaaaagacctcgttacatttatggtgtacgaggtctttaatttat

Structure prediction (MFold)

External links to target and structure prediction

Target RNA2
RNA predator
MFold
CopraRNA
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