Organism

NCTC8325
SRD identifierCommon nameIntaRNAStartEndStrandLengthOther namesExperimental ValidationRNA-seq ValidationCategoryAuthors (references)
srn_1670Teg20as 659279660287+1009Teg20as_sRNA141Antisense

Sequence

>NCTC8325_srn_1670_Teg20as
gtataacaaattaaatcattatatagtcaacttagttgcattattttgatttttaatatattatgcatttaatttaatcaaataggtaggttgttaatttttacctaactaccattcatacaaaatataaatatgtatgatagggaagggtgagataattttttgtaccaaaatgaaaatttttttcaaaaataaaaaactagcaatctcacatgatgtgaattgctagtatatatcagtacaatttatttaattaatggatgaatgcatagctagaaacttctgaagctggaattgtacggtagttcatattgtatggaccatatgtgtaattcatttcagaaatcaagatactaccatcaccattgacacgttcaacataagcaacatgaccatatggaccaggtgtgctttgcataattgaaccaactgatggtgtgttgtttacttggtaaccatcattagctgcgttaccagcccaatacttagcgtctgaccaatatgtgctaattggactaccagcttgagcacgacggtcaaatacgtaccatgtacattgaccagcagtgtataaattttggtgattaaaagatgatgcattgccattgctacctgttgtagctgttggtgttgtaccacctgatccaccattaggaatttgtaatgtttggttaggcataattaaataaccacgtaagttattggctgccattaattgatcaactgaaacaccatatctgctagcaatgatatttaatgattcaccagcttgtacagtatgagatgatgctgaaccagcttgtggagaagtgtttgacgtattttgtgcatcacttccacctactgagataacttgaccagggaataccaagttgttatctaattggttattttgtttaatactctctactgaagtgttgtatttttgagcaatactccataatgattcaccagattgtactgtatgttgtgtagaagcttgtgcatcatgatgcgttaaaaatgcagc

Structure prediction (MFold)

External links to target and structure prediction

Target RNA2
RNA predator
MFold
CopraRNA
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